MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella woodyi ATCC 51908 chromosome

Total Repeats: 91352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010506	GCA	2	6	414	419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724371
2	NC_010506	CAG	2	6	454	459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724371
3	NC_010506	GATG	2	8	492	499	25 %	25 %	50 %	0 %	170724371
4	NC_010506	AC	3	6	503	508	50 %	0 %	0 %	50 %	170724371
5	NC_010506	ATC	2	6	568	573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724371
6	NC_010506	GGT	2	6	675	680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724371
7	NC_010506	A	6	6	707	712	100 %	0 %	0 %	0 %	170724371
8	NC_010506	CCTA	2	8	781	788	25 %	25 %	0 %	50 %	170724371
9	NC_010506	GGC	2	6	834	839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170724371
10	NC_010506	GGT	2	6	865	870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724371
11	NC_010506	TTA	2	6	922	927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170724371
12	NC_010506	CAT	2	6	945	950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724371
13	NC_010506	TA	3	6	977	982	50 %	50 %	0 %	0 %	170724371
14	NC_010506	AAT	2	6	1027	1032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170724371
15	NC_010506	TAC	2	6	1054	1059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724371
16	NC_010506	GAT	2	6	1084	1089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724371
17	NC_010506	TAA	2	6	1104	1109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170724371
18	NC_010506	AGAT	2	8	1110	1117	50 %	25 %	25 %	0 %	170724371
19	NC_010506	ATC	2	6	1163	1168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724371
20	NC_010506	ATC	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724371
21	NC_010506	ACC	2	6	1266	1271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170724371
22	NC_010506	AG	3	6	1314	1319	50 %	0 %	50 %	0 %	170724371
23	NC_010506	T	6	6	1348	1353	0 %	100 %	0 %	0 %	170724371
24	NC_010506	ATA	2	6	1511	1516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170724371
25	NC_010506	TAC	2	6	1537	1542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724371
26	NC_010506	CGT	2	6	1573	1578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724371
27	NC_010506	TGG	2	6	1668	1673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724371
28	NC_010506	GAA	2	6	1726	1731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170724371
29	NC_010506	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170724371
30	NC_010506	TGA	2	6	1803	1808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724372
31	NC_010506	GA	3	6	1868	1873	50 %	0 %	50 %	0 %	170724372
32	NC_010506	TAG	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724372
33	NC_010506	AGTG	2	8	1912	1919	25 %	25 %	50 %	0 %	170724372
34	NC_010506	TCAC	2	8	1921	1928	25 %	25 %	0 %	50 %	170724372
35	NC_010506	TTGG	2	8	1961	1968	0 %	50 %	50 %	0 %	170724372
36	NC_010506	CAC	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170724372
37	NC_010506	GAA	2	6	2020	2025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170724372
38	NC_010506	CGG	2	6	2139	2144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170724372
39	NC_010506	TTG	2	6	2276	2281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170724372
40	NC_010506	TGC	2	6	2301	2306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724372
41	NC_010506	CGAC	2	8	2316	2323	25 %	0 %	25 %	50 %	170724372
42	NC_010506	CAGA	2	8	2347	2354	50 %	0 %	25 %	25 %	170724372
43	NC_010506	GTT	2	6	2402	2407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170724372
44	NC_010506	CGA	2	6	2478	2483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724372
45	NC_010506	TCG	2	6	2536	2541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724372
46	NC_010506	GCG	2	6	2556	2561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170724372
47	NC_010506	ATC	2	6	2586	2591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724372
48	NC_010506	ACT	2	6	2602	2607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724372
49	NC_010506	GTG	2	6	2640	2645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724372
50	NC_010506	TTAA	2	8	2669	2676	50 %	50 %	0 %	0 %	170724372
51	NC_010506	AGG	3	9	2700	2708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170724372
52	NC_010506	GGA	2	6	2710	2715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170724372
53	NC_010506	GAT	2	6	2804	2809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724372
54	NC_010506	TTGA	2	8	2846	2853	25 %	50 %	25 %	0 %	170724372
55	NC_010506	TATG	2	8	2875	2882	25 %	50 %	25 %	0 %	170724372
56	NC_010506	ATCT	2	8	3290	3297	25 %	50 %	0 %	25 %	170724373
57	NC_010506	GATAA	2	10	3424	3433	60 %	20 %	20 %	0 %	170724373
58	NC_010506	AG	3	6	3483	3488	50 %	0 %	50 %	0 %	170724373
59	NC_010506	AAC	2	6	3728	3733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170724373
60	NC_010506	GA	3	6	3843	3848	50 %	0 %	50 %	0 %	170724373
61	NC_010506	GCG	2	6	3853	3858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170724373
62	NC_010506	ACA	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170724373
63	NC_010506	TGG	2	6	4025	4030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724373
64	NC_010506	TTG	2	6	4072	4077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170724373
65	NC_010506	ACCAC	2	10	4150	4159	40 %	0 %	0 %	60 %	170724373
66	NC_010506	GT	3	6	4188	4193	0 %	50 %	50 %	0 %	170724373
67	NC_010506	CGA	2	6	4211	4216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724373
68	NC_010506	GA	3	6	4215	4220	50 %	0 %	50 %	0 %	170724373
69	NC_010506	ATA	2	6	4221	4226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170724373
70	NC_010506	TTC	2	6	4246	4251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170724374
71	NC_010506	CGA	2	6	4318	4323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724374
72	NC_010506	CAC	2	6	4337	4342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170724374
73	NC_010506	ACG	2	6	4398	4403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724374
74	NC_010506	ATC	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724374
75	NC_010506	GAT	2	6	4445	4450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724374
76	NC_010506	TGG	2	6	4528	4533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724374
77	NC_010506	GAT	2	6	4541	4546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724374
78	NC_010506	TGG	2	6	4564	4569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724374
79	NC_010506	GGTGTT	2	12	4577	4588	0 %	50 %	50 %	0 %	170724374
80	NC_010506	TCG	2	6	4630	4635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724374
81	NC_010506	CAA	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170724374
82	NC_010506	CT	3	6	4805	4810	0 %	50 %	0 %	50 %	170724374
83	NC_010506	TGA	2	6	4843	4848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724374
84	NC_010506	TCT	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170724374
85	NC_010506	CAA	2	6	5038	5043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170724374
86	NC_010506	TGG	2	6	5059	5064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724374
87	NC_010506	GAT	2	6	5165	5170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724374
88	NC_010506	AAGCT	2	10	5328	5337	40 %	20 %	20 %	20 %	170724374
89	NC_010506	GCCCGT	2	12	5363	5374	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170724374
90	NC_010506	GCG	2	6	5378	5383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170724374
91	NC_010506	TCG	2	6	5404	5409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724374
92	NC_010506	CTG	2	6	5508	5513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724374
93	NC_010506	TTA	2	6	5637	5642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170724374
94	NC_010506	TGA	2	6	5668	5673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724374
95	NC_010506	CTT	3	9	5764	5772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170724374
96	NC_010506	TA	3	6	5829	5834	50 %	50 %	0 %	0 %	170724374
97	NC_010506	GAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170724374
98	NC_010506	GAT	2	6	5870	5875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724374
99	NC_010506	CTAA	2	8	5894	5901	50 %	25 %	0 %	25 %	170724374
100	NC_010506	TGG	2	6	5914	5919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724374
101	NC_010506	ATCC	2	8	5924	5931	25 %	25 %	0 %	50 %	170724374
102	NC_010506	TGA	2	6	6091	6096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724374
103	NC_010506	GTG	2	6	6112	6117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724374
104	NC_010506	TGG	2	6	6154	6159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724374
105	NC_010506	TACC	2	8	6206	6213	25 %	25 %	0 %	50 %	170724374
106	NC_010506	CTT	2	6	6250	6255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170724374
107	NC_010506	TGA	2	6	6294	6299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724374
108	NC_010506	TTGA	2	8	6326	6333	25 %	50 %	25 %	0 %	170724374
109	NC_010506	GGT	2	6	6338	6343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724374
110	NC_010506	GTG	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724374
111	NC_010506	AGG	2	6	6369	6374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170724374
112	NC_010506	AATG	2	8	6406	6413	50 %	25 %	25 %	0 %	170724374
113	NC_010506	TA	3	6	6429	6434	50 %	50 %	0 %	0 %	170724374
114	NC_010506	CGT	2	6	6590	6595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724374
115	NC_010506	TTG	2	6	7130	7135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170724375
116	NC_010506	TTCT	2	8	7180	7187	0 %	75 %	0 %	25 %	170724375
117	NC_010506	TAA	2	6	7212	7217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170724375
118	NC_010506	CAG	2	6	7284	7289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724375
119	NC_010506	CCT	2	6	7305	7310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170724375
120	NC_010506	CAT	2	6	7329	7334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724375
121	NC_010506	AT	3	6	7337	7342	50 %	50 %	0 %	0 %	170724375
122	NC_010506	GC	3	6	7374	7379	0 %	0 %	50 %	50 %	170724375
123	NC_010506	CAT	2	6	7389	7394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724375
124	NC_010506	GCTA	2	8	7474	7481	25 %	25 %	25 %	25 %	170724375
125	NC_010506	TGG	2	6	7554	7559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724375
126	NC_010506	GTG	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724375
127	NC_010506	TAGA	2	8	7722	7729	50 %	25 %	25 %	0 %	170724375
128	NC_010506	AAT	2	6	7787	7792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170724375
129	NC_010506	AGT	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724375
130	NC_010506	GCT	3	9	7890	7898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724375
131	NC_010506	ATTA	2	8	7951	7958	50 %	50 %	0 %	0 %	170724375
132	NC_010506	A	6	6	8091	8096	100 %	0 %	0 %	0 %	170724375
133	NC_010506	TGT	2	6	8215	8220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170724375
134	NC_010506	TAGA	2	8	8224	8231	50 %	25 %	25 %	0 %	170724375
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138	NC_010506	CATG	2	8	8364	8371	25 %	25 %	25 %	25 %	170724376
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143	NC_010506	GT	3	6	8746	8751	0 %	50 %	50 %	0 %	170724376
144	NC_010506	TGT	2	6	8815	8820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170724376
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242	NC_010506	A	8	8	15536	15543	100 %	0 %	0 %	0 %	170724381
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259	NC_010506	GTT	2	6	16571	16576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170724382
260	NC_010506	GTTT	2	8	16621	16628	0 %	75 %	25 %	0 %	170724382
261	NC_010506	GAA	3	9	16641	16649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170724382
262	NC_010506	TCGAT	2	10	16715	16724	20 %	40 %	20 %	20 %	170724382
263	NC_010506	GTA	2	6	16748	16753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724382
264	NC_010506	CTG	2	6	16820	16825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724382
265	NC_010506	CCT	2	6	16892	16897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170724382
266	NC_010506	ATC	2	6	16905	16910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724382
267	NC_010506	ACC	2	6	16926	16931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170724382
268	NC_010506	TG	3	6	17154	17159	0 %	50 %	50 %	0 %	170724382
269	NC_010506	CTTG	2	8	17181	17188	0 %	50 %	25 %	25 %	170724382
270	NC_010506	CAA	2	6	17273	17278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170724382
271	NC_010506	TGA	2	6	17287	17292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724382
272	NC_010506	AGCCC	2	10	17358	17367	20 %	0 %	20 %	60 %	170724382
273	NC_010506	GGC	2	6	17370	17375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170724382
274	NC_010506	GGC	2	6	17483	17488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170724382
275	NC_010506	ATTC	2	8	17637	17644	25 %	50 %	0 %	25 %	170724382
276	NC_010506	ATA	2	6	17693	17698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170724383
277	NC_010506	TCA	2	6	17883	17888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724383
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279	NC_010506	TCT	2	6	18201	18206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170724383
280	NC_010506	CAT	2	6	18217	18222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724383
281	NC_010506	TGC	2	6	18489	18494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724383
282	NC_010506	TGA	2	6	18756	18761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724384
283	NC_010506	ATG	2	6	18779	18784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724384
284	NC_010506	CAGG	2	8	18850	18857	25 %	0 %	50 %	25 %	170724384
285	NC_010506	AGC	2	6	18884	18889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724384
286	NC_010506	CAT	2	6	18927	18932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724384
287	NC_010506	TGA	3	9	18942	18950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724384
288	NC_010506	GAG	2	6	18958	18963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170724384
289	NC_010506	TAA	2	6	18972	18977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170724384
290	NC_010506	ATC	2	6	19012	19017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724384
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292	NC_010506	G	6	6	19096	19101	0 %	0 %	100 %	0 %	170724384
293	NC_010506	A	6	6	19183	19188	100 %	0 %	0 %	0 %	170724384
294	NC_010506	TTG	2	6	19202	19207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170724384
295	NC_010506	ACA	2	6	19261	19266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170724384
296	NC_010506	TAT	2	6	19276	19281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170724384
297	NC_010506	AAGA	2	8	19307	19314	75 %	0 %	25 %	0 %	170724384
298	NC_010506	A	6	6	19719	19724	100 %	0 %	0 %	0 %	170724385
299	NC_010506	CTGT	2	8	19813	19820	0 %	50 %	25 %	25 %	170724385
300	NC_010506	TGA	2	6	19897	19902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724385
301	NC_010506	AGC	2	6	19998	20003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724385
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304	NC_010506	AGT	2	6	20204	20209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724385
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322	NC_010506	CT	3	6	21427	21432	0 %	50 %	0 %	50 %	170724385
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324	NC_010506	TAC	2	6	21617	21622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724385
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382	NC_010506	TAGG	2	8	25611	25618	25 %	25 %	50 %	0 %	170724390
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